Existem referencias a este antigo templo, desde o reinado de D. Fernando, altura em que servia de paroquial de São Tiago. Na época de Filipe I (1590) sofreu remodelações que alteraram definitivamente a sua feição medieval e em 1624, devido ao estado de abandono foi reconstruída segundo o gosto da época.
Em 1932 a sua fachada foi totalmente renovada no estilo da Renascença tardia italiana
No seu interior os azulejos, imagens e pinturas vieram da igreja e convento das Mónicas em Lisboa.
É de salientar o altar dedicado a São Sesinando e uma relíquia deste santo, natural e padroeiro de Beja, martirizado em Córdoba a 16 de julho de 851.
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