Foi o primeiro convento a ser construído nas terras conquistadas aos árabes e fica localizado fora da cintura de muralhas e em frente das principais portas da cidade, as Portas de Mértola.
Fundado em 1268, foi secularizado em 1852 e pouco tempo depois adaptado a quartel, o que levou à destruição da Capela dos Ossos, idêntica à de Évora.
A fachada é composta por 3 grandes arcos entaipados e que comunica com um amplo pátio que antecede a igreja conventual. O Pórtico da igreja, no estilo maneirista tem o símbolo dos Franciscanos no frontão. Ao lado abre-se o claustro, constituído por 4 galerias e um pátio descoberto com uma cisterna ao centro. Estas galerias remontam aos séculos XVI e XVII.
