Fue el primer convento que se construyó en las tierras conquistadas a los árabes y está situado fuera del cinturón de murallas y frente a la puerta principal de la ciudad, las Portas de Mértola.

Fundado en 1268, fue exclaustrado en 1852 y poco después adaptado a cuartel, lo que provocó la destrucción de la Capela dos Ossos, idéntica a la de Évora.
La fachada está formada por 3 grandes arcos tapiados que comunican con un gran patio que antecede a la iglesia del convento. El pórtico de la iglesia, de estilo manierista, tiene en el frontón el símbolo de los franciscanos. Al lateral se abre el claustro, formado por 4 galerías y un patio descubierto con un aljibe en el centro. Estas galerías datan de los siglos XVI y XVII.